À l’approche de ses quinze ans, Artemis Fowl semble avoir changé. Devenu étrangement généreux et préoccupé par l’avenir de la planète, il inquiète ses alliés du peuple des fées. Rapidement, le diagnostic tombe : Artemis souffre du complexe d’Atlantis, un trouble mental qui fragmente sa personnalité. Alors que des robots surgissent et menacent de détruire la cité d’Atlantis, Artemis, Holly Short, Butler et leurs compagnons sont entraînés dans une course contre la montre entre l’Islande, les profondeurs de l’océan et des territoires hostiles. Mais comment sauver le monde quand le plus dangereux des ennemis se cache dans son propre esprit ?